在有限的細(xì)胞核空間中,基因組的大部分是緊密折疊的,僅留下需要轉(zhuǎn)錄的部分是開放的?;罨恼{(diào)控序列上結(jié)合有轉(zhuǎn)錄因子,轉(zhuǎn)錄因子會(huì)招募其他蛋白啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄。人體內(nèi)有些基因幾乎一直處于開啟狀態(tài),有些基因用過(guò)之后就被閑置在一邊,它們的活性都處于嚴(yán)格的調(diào)控之下。ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing),利用DNA轉(zhuǎn)座酶結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù),來(lái)研究染色體的可進(jìn)入性。ATAC-seq 只需要很少的細(xì)胞就能鑒定基因組中所有活躍的調(diào)控序列。
生物信息學(xué)分析內(nèi)容
