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疾病研究(心、肝、肺)

疾病研究(心、肝、肺)

  基于對(duì)病毒載體的深入了解和研發(fā),越來(lái)越多的科研人員開(kāi)始借助病毒載體進(jìn)行疾病研究。目前,病毒載體工具在不同組織器官中均有大量的應(yīng)用,通過(guò)使用工具病毒載體,對(duì)疾病相關(guān)基因進(jìn)行定向和組織特異性的改造和操控,已成為科研人員進(jìn)行疾病研究與治療的一種技術(shù)手段。

  病毒載體的選擇
  
  不同病毒載體的大小迥異,意味著其內(nèi)含基因容量存在巨大差異;免疫原性的不同,意味著其體內(nèi)/體外應(yīng)用的場(chǎng)景需要細(xì)微調(diào)整;表達(dá)時(shí)間和周期的不同,意味著九游會(huì)j9需要根據(jù)研究需求進(jìn)行相對(duì)應(yīng)的選擇。

表1 不同病毒的生物學(xué)特性比較
  慢病毒 腺相關(guān)病毒 腺病毒 逆轉(zhuǎn)錄病毒
包膜 無(wú)
顆粒直徑 80-100 nm 20-30 nm 90-100nm ~100nm
基因組 dsRNA ssDNA dsDNA RNA
基因組大小 9.75kb 4.7kb 36kb ~5kb
表達(dá)起始時(shí)間 48-72h 72-96h 24-48h 48-72h
表達(dá)持續(xù)時(shí)間 > 2 months > 6 months < 1 month > 2 months
體內(nèi)擴(kuò)散能力 一般 強(qiáng) 強(qiáng) 一般
免疫原性 中等 極低 強(qiáng) 中等
滴度范圍 108~109TU/mL 1012-1013VG/mL 1011-1012PFU/mL 107~108TU/mL
滴度檢測(cè)方法 qPCR整合DNA qPCR非整合DNA 抗原抗體免疫染色試劑盒 qPCR整合DNA
整合方式 隨機(jī)高頻整合 定向低頻整合(rAAV不整合) 非整合 隨機(jī)整合
應(yīng)用范圍 體外細(xì)胞感染,gRNA文庫(kù)篩。迥 基于不同的血清型,體內(nèi)廣泛應(yīng)用 嗜肝,快速表達(dá)或短期表達(dá),血液、心臟,細(xì)胞系等  特異性只感染分裂期的細(xì)胞
  重組腺相關(guān)病毒載體(rAAV),一直是體內(nèi)研究的明星載體,除了其免疫原性極低、安全性高、宿主細(xì)胞范圍廣、擴(kuò)散能力強(qiáng)、體內(nèi)表達(dá)基因時(shí)間長(zhǎng)等優(yōu)勢(shì)外,還在于其種類多樣性。
  
  現(xiàn)在研究中常用的rAAV就是利用AAV2型基因組與不同的衣殼蛋白結(jié)合產(chǎn)生的混合體病毒載體,一般標(biāo)記為rAAV2/N (N為不同的衣殼血清型)。重組的病毒具有AAV2型的穩(wěn)定表達(dá)和基因整合能力,同時(shí)獲得了不同血清型的組織感染嗜親性,表現(xiàn)出一定的器官靶向特異性。
表2 不同血清型AAV的組織嗜親性
血清型 組織親和性
rAAV2/1 神經(jīng)系統(tǒng)(高滴度順向跨突觸),肌肉,骨骼。募。交
rAAV2/2 神經(jīng)系統(tǒng),肌肉,肝臟,血管平滑肌,眼
rAAV2/3 肌肉,肝臟,肺,眼
rAAV2/4 神經(jīng)系統(tǒng),肌肉,眼,腦
rAAV2/5 神經(jīng)系統(tǒng),肺,視網(wǎng)膜,肝臟,滑膜關(guān)節(jié)
rAAV2/6 神經(jīng)系統(tǒng),肺,肌肉,心臟
rAAV2/7 肌肉,肝臟
rAAV2/8 神經(jīng)系統(tǒng),肝臟,胰腺,視網(wǎng)膜,脂肪組織
rAAV2/9 神經(jīng)系統(tǒng),心。,視網(wǎng)膜,皮膚,肌肉,脂肪組織
rAAV2-retro 神經(jīng)系統(tǒng)(逆向非跨突觸)
AAV-PHP.eB 跨血腦屏障(靜脈注射)
AAV-PHP.S 全外周神經(jīng)(尾靜脈注射)
AAV-PAN 胰腺(腹腔注射)
AAV-LUNG 肺(尾靜脈注射)
AAV-DJ 視網(wǎng)膜,肺,腎臟,體外感染細(xì)胞
AAV-7m8 視網(wǎng)膜
AAV-ShH10Y 視網(wǎng)膜Muller細(xì)胞
AAV-Rh10 肝臟,血液,心臟,體外感染細(xì)胞
AAV-Anc80L65 內(nèi)耳、視網(wǎng)膜、骨骼肌、肝臟
AAV-SCH9 SVZ區(qū)神經(jīng)干細(xì)胞
 
  小建議:如您不確定選擇哪種血清型,可嘗試使用九游會(huì)j9生物Pandora’s Virus (AAV試用裝)進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),通過(guò)比較不同血清型對(duì)目標(biāo)組織的感染效果,摸索最佳實(shí)驗(yàn)條件(注射方法、注射位點(diǎn)、病毒用量等),以便得到更理想的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。(鏈接到Pandora’s Virus>>)

肝臟

  肝臟是調(diào)控機(jī)體脂質(zhì)代謝、血糖代謝的重要器官,其功能異常會(huì)導(dǎo)致脂肪肝、高膽固醇血癥、高血脂癥、糖尿病等疾病。
  
  1、注射方式
  
  應(yīng)用病毒載體感染肝臟一般采用尾靜脈注射的方式。
  
  按照九游會(huì)j9生物多年的經(jīng)驗(yàn),使用AAV載體感染肝臟組織一般選取AAV2/8血清型,通過(guò)尾靜脈注射手段感染肝臟每只小鼠需要注射1x1010總滴度的病毒載體。
 
  
  九游會(huì)j9生物AAV感染結(jié)果
  
  2、應(yīng)用案例
  
  2.1 肝臟特異啟動(dòng)子TBG
  
  客戶發(fā)表文章:FASEB Journal. (IF=5.391). Yang Y,et.al. (2018). Long-term exercise prevents hepatic steatosis: a novel role of FABP1 in regulation of autophagy-lysosomal machinery. [非酒精性脂肪肝,自噬溶酶體,腺相關(guān)病毒過(guò)表達(dá)]
`
  
  注射方式:小鼠尾靜脈注射
  
  載體:AAV8-TBG-Fabp1
  
  血清型:rAAV2/8
  
  注射量:200ul,2× 1011 VG
  
  觀察時(shí)間:1周
  
  2.2 Cre-loxp技術(shù)在小鼠肝臟中的應(yīng)用
  
  由于腺病毒高度嗜肝,幾乎90%以上會(huì)感染肝臟,因此腺病毒可以作為肝臟特異性感染的有效載體。將Cre腺病毒(Ad-Cre)通過(guò)尾靜脈注射入帶有l(wèi)oxp小鼠體內(nèi),即可實(shí)現(xiàn)肝臟特異性表達(dá)并將目的基因敲除,從而快速獲取肝臟特異性基因敲除小鼠。
  
  2.3 CRISPR/Cas9技術(shù)在小鼠肝臟中的應(yīng)用
  
  通過(guò)腺病毒將CRISPR/Cas9系統(tǒng)相關(guān)元件(Cas9和sgRNA)注射入小鼠體內(nèi),可以實(shí)現(xiàn)在肝臟中特異性表達(dá),并實(shí)現(xiàn)肝臟部位的特異性敲除。此方法比較適合檢驗(yàn)活體實(shí)驗(yàn)。

胰腺

  胰腺是一個(gè)兼有內(nèi)、外分泌功能的器官,與機(jī)體消化、血糖代謝、脂質(zhì)代謝等有密切的關(guān)系,也是代謝研究的關(guān)鍵目標(biāo)器官之一。
  
  在實(shí)際研究中,使用病毒載體感染胰腺主要有兩種方式,一種是使用AAV2/8病毒載體,通過(guò)膽管將病毒注射入胰腺;另一種新方法是使用九游會(huì)j9生物新研發(fā)的AAV-PAN病毒載體,腹腔注射感染胰腺:
九游會(huì)j9生物AAV-PAN感染結(jié)果

心臟

  1、注射方式
  
  AAV的注射方式,不同的文章中采用了不一樣的注射方式??傮w上,一般包括靜脈注射、心腔內(nèi)注射、心肌內(nèi)定點(diǎn)注射、心包內(nèi)注射(介于心肌與心包膜之間),其中靜脈注射包括尾靜脈注射、頸靜脈注射、面部靜脈注射等。
  
  尾靜脈注射和心腔內(nèi)注射由于病毒流進(jìn)血液循環(huán),分布較均勻。心腔內(nèi)注射需要結(jié)合主動(dòng)脈嵌夾進(jìn)行,由于開(kāi)胸腔手術(shù)需要輔助呼吸,對(duì)手術(shù)操作要求較高。心肌內(nèi)定點(diǎn)注射時(shí)每點(diǎn)注射2-5ul,效果是在注射的局部點(diǎn)附近表達(dá)較高,但擴(kuò)散非常有限。總的來(lái)說(shuō),很多實(shí)驗(yàn)直接用尾靜脈注射即可,但是可能需要較高劑量的病毒,如果用心肌內(nèi)定點(diǎn)注射,即小量多點(diǎn)注射,可以達(dá)到很好的感染表達(dá)效果,但是后者操作技術(shù)難度略高,也需要花費(fèi)更長(zhǎng)的操作時(shí)間。
  
  結(jié)合新生鼠(出生2-10天)注射效果比較來(lái)看,新生鼠注射表達(dá)效果大大優(yōu)于成年鼠,消耗病毒劑量也相對(duì)較低。新生鼠的注射,一般根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的條件來(lái)看,可以選擇頸靜脈注射、面部靜脈注射和心腔內(nèi)(左心室)注射,目的是將病毒導(dǎo)入血液循環(huán)中。
  
  2、啟動(dòng)子選擇
  
  一些常用啟動(dòng)子如CMV、CAG、αMHC、cTnC等常被用于驅(qū)動(dòng)在心臟組織中的表達(dá)。很多高效的啟動(dòng)子由于片段較大,如αMHC,僅用于轉(zhuǎn)基因小鼠等實(shí)驗(yàn),不適合裝載在AAV載體上。通過(guò)查閱文獻(xiàn),九游會(huì)j9發(fā)現(xiàn)一些小的啟動(dòng)子如CMV在心臟組織的表達(dá)能力比較強(qiáng),特別對(duì)于大片段的驅(qū)動(dòng)效果很明顯,但是如果需要介導(dǎo)的目的基因在心臟中特異性表達(dá),則推薦使用cTnT啟動(dòng)子,cTnT常被用于心肌的特異性表達(dá),表達(dá)能力也很強(qiáng)。
  
  3、應(yīng)用案例
  
  3.1 心臟特異性啟動(dòng)子cTNT
  
  客戶發(fā)表文章:Yue Z, et al., (2019) PDGFR-b Signaling Regulates Cardiomyocyte Proliferation and Myocardial Regeneration. Cell Rep.
  
  注射方式:
  
  載體:AAV9
  
  血清型:rAAV2/9
  
  啟動(dòng)子:cTnT
  
  注射量:200ul,2× 1011 VG
  
  觀察時(shí)間:1周
  
  3.2 Cas9心臟特異性轉(zhuǎn)基因小鼠
  
  科學(xué)家構(gòu)建了帶有eSpCas9(1.1)的心臟特異性轉(zhuǎn)基因小鼠,通過(guò)Myh6基因的啟動(dòng)子(αMHC)驅(qū)動(dòng)Cas9在心肌的特異性表達(dá)。αMHC啟動(dòng)子是心臟特異性轉(zhuǎn)基因小鼠常用啟動(dòng)子。這個(gè)工具小鼠能夠解決實(shí)驗(yàn)過(guò)程中Cas9在心臟遞送和表達(dá)的難題。轉(zhuǎn)基因小鼠可以維持Cas9在心臟長(zhǎng)期高水平的表達(dá),而這個(gè)正是CRISPR/Cas9系統(tǒng)在心臟部位編輯效率不高的癥結(jié)所在。
  
  Cas9轉(zhuǎn)基因小鼠,只需要通過(guò)AAV遞送sgRNA到心臟表達(dá)即可實(shí)現(xiàn),這種方法可以獲得比較高的編輯效率。研究人員將靶向Myh6基因外顯子sgRNA通過(guò)裝載在AAV載體上注射入小鼠,實(shí)現(xiàn)心臟特異性敲除。Myh6表達(dá)水平降低50%以上,同時(shí)成功得到發(fā)生心肌肥厚和擴(kuò)張型心臟的突變小鼠。

肺部

  目前對(duì)于肺部的病毒感染,普遍采用AAV病毒載體,使用病毒載體感染胰腺主要有兩種方式,一種是使用AAV2/9病毒載體,通過(guò)鼻內(nèi)或氣管內(nèi)遞送(經(jīng)呼吸道)將病毒通過(guò)肺呼吸道遞送,參考劑量是1×1011VG病毒,體積50ul;另一種新方法是使用九游會(huì)j9生物新研發(fā)的AAV-LUNG病毒載體,尾靜脈注射特異性感染肺部:
  

  九游會(huì)j9AAV-LUNG感染肺部結(jié)果

肌肉

  目前,對(duì)于肌肉組織中使用的病毒載體通常會(huì)選用AAV病毒載體,因?yàn)锳AV不僅能夠高效特異地靶向肌肉組織,且能在肌肉組織中表達(dá)持久。腺病毒使用時(shí)容易引起較強(qiáng)的免疫反應(yīng),并且很容易被清除,表達(dá)時(shí)間比較短暫,較少被應(yīng)用于肌肉組織的靶向表達(dá)。盡管慢病毒感染表達(dá)范圍廣泛,對(duì)培養(yǎng)的肌肉細(xì)胞均能高效表達(dá),但是對(duì)肌肉組織的感染表達(dá)非常有限。目前靶向肌肉的AAV載體血清型主要為AAV1,AAV6和AAV9。其中,AAV9的表達(dá)效率最高,并且更容易在肌肉中高表達(dá)。
  
  1、注射方式
  
  應(yīng)用病毒載體感染肌肉組織進(jìn)行研究,一般分為系統(tǒng)注射和肌肉內(nèi)注射,系統(tǒng)注射表達(dá)較均勻,但是大部分病毒會(huì)被其他臟器組織吸收,導(dǎo)致靶向肌肉的病毒較少。肌肉內(nèi)注射是一種定點(diǎn)注射,可以在注射點(diǎn)附近高效表達(dá),但缺點(diǎn)是病毒擴(kuò)散十分有限,因此往往需要多點(diǎn)注射,一般每個(gè)點(diǎn)在5-10ul。
  
  2、應(yīng)用案例
  
  注射方式:靜脈注射
  
  載體:AAV-CMV-miniDystrophin
  
  血清型:rAAV2/9
  
  觀察時(shí)間:16周

脂肪組織

  脂肪組織由大量脂肪細(xì)胞組成,分為白色脂肪、棕色脂肪和米色脂肪組織,脂肪組織是機(jī)體冗余能量?jī)?chǔ)存的重要器官,同時(shí)也是重要的分泌器官,在機(jī)體的血糖代謝、脂質(zhì)代謝、慢性炎癥、傷疤修復(fù)等中有重要的生理功能。
  
  研究中,如果九游會(huì)j9使用病毒載體感染脂肪組織,一般采用定點(diǎn)注射的方式。使用AAV病毒載體感染脂肪組織一般選取rAAV2/8血清型,在脂肪組織的多點(diǎn)注射中,每個(gè)點(diǎn)注射量大約1x1010總滴度的病毒載體。

  AAV感染脂肪

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