坊間盛傳的rAAV載體空殼率大比拼
腺相關病毒(Adeno-associated virus, AAV)是表達基因序列的理想載體,由于其種類多樣、免疫原性低、擴散能力強、宿主范圍廣等優(yōu)勢在基因功能研究和基因治療遞送載體中占據(jù)主導地位。目前FDA已批準了兩款基于AAV的基因治療藥物,近年來,隨著對AAV衣殼開發(fā)和基因組優(yōu)化的研究深入,更加推動了AAV在基因研究和基因治療領域的應用。
腺相關病毒載體
腺相關病毒(Adeno-associated virus,AAV)是微小病毒科(Parvoviridae)家族的成員之一,是一類無法自主復制、無被膜、具有二十面體結構的微小病毒,其直徑約20-26nm,含有4.7kb左右的線狀單鏈DNA作為基因組。
重組腺相關病毒載體(recombinant AAV, rAAV)是在非致病的野生型AAV基礎上改造而成的基因載體,研究中采用的rAAV通常為AAV2型基因組與不同的衣殼蛋白結合產(chǎn)生的混合體病毒載體。
rAAV載體空殼率
隨著rAAV載體的基礎研究、臨床前研究和臨床研究的不斷深入,在rAAV載體制備過程中,產(chǎn)品質量穩(wěn)定性、純度是產(chǎn)品質控的重要內容。
rAAV衣殼是由60個衣殼蛋白亞單位構成,排列成二十面體結構,包含載體DNA基因組。在rAAV載體制備過程中,除了含有全長DNA基因組的完整rAAV載體外,有一定比例的rAAV顆粒不含任何DNA基因組,被稱為空病毒顆粒。在Rep蛋白的參與下,組裝好的空病毒顆粒向核質遷移,而DNA的包裝則發(fā)生在已組裝完畢的空病毒顆粒遷移至核質后,這促進了形成空病毒顆粒的概率。
此外,還存在一定比例的含有部分DNA的病毒顆粒,DNA過度裝載的病毒顆粒,以及rAAV多聚體(圖1)。
圖1 rAAV制備過程中產(chǎn)生的病毒顆粒主要類型(圖片來源:參考文獻1)
rAAV載體空殼率高所帶來的影響
現(xiàn)有研究發(fā)現(xiàn),大量空病毒顆粒的存在可能會影響rAAV載體的有效性和安全性,因為它們可能會增加rAAV載體的免疫原性,增加免疫毒性的風險,或通過競爭細胞表面受體結合位點、內吞作用及胞內過程,影響rAAV轉導效率。因此,在rAAV載體制備和純化過程中,優(yōu)化生產(chǎn)工藝、建立有效的純化方法,以降低rAAV空病毒顆粒數(shù),盡可能純化獲得含有全長DNA基因組的完整rAAV載體,確保rAAV載體安全、穩(wěn)定、有效,是產(chǎn)品質控標準的重要一環(huán)。
如何獲得空殼率更低、更可控的載體?
目前對于去除rAAV載體中的空病毒顆粒主要是在病毒純化過程中實現(xiàn)的,策略依賴于rAAV載體和空病毒顆粒的物理性質差異。
密度梯度離心法(Density gradient ultracentrifugation, DGC):空病毒顆粒(不含DNA基因組)和含有部分DNA的病毒顆粒在較低的密度區(qū)間聚集,因此借助碘克沙醇或氯化銫(CsCl)經(jīng)過多次密度梯度離心后,可以很容易將空病毒顆粒與rAAV載體分離,DGC法目前適用于所有血清型的純化。
離子交換層析法(ion-exchange chromatography, IEC):rAAV載體的等電點會比空病毒顆粒略低,因此借助IEC法可以將空病毒顆粒去除。IEC法目前在某些血清型載體(如rAAV1、2、6)中去除空殼效果不錯,然而對于不同血清型的rAAV載體可能需要建立不同的純化方法。
低空殼率rAAV大起底
空殼的腺相關病毒會為科學研究和基因治療藥物開發(fā)帶來不可控因素和風險,因此人們在不斷探索控制空殼rAAV載體產(chǎn)生的辦法??諝AAV的形成與病毒生產(chǎn)時的質粒配比、細胞培養(yǎng)水平、rAAV出毒時間均有一定關系,而下游腺相關病毒純化過程更是減少空殼rAAV的重要核心環(huán)節(jié)。
基于12年、30000+的病毒載體生產(chǎn)經(jīng)驗,九游會j9生物持續(xù)優(yōu)化病毒生產(chǎn)全流程,用更優(yōu)化的質粒配比、病毒收獲時間,借助超離、超濾、層析、PEG沉淀等科研及工業(yè)生產(chǎn)中的整合純化工藝,持續(xù)降低rAAV載體包裝中的空殼率,可做到<5%空殼率(實際工作中通常<2%),為研究者提供更好的基因載體。
2021年,九游會j9選擇同一載體、不同生產(chǎn)廠商的腺相關病毒,發(fā)起了空殼率雙盲測試,電鏡結果顯示,九游會j9生物的腺相關病毒空殼率遠低于行業(yè)一線品牌。
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圖2 rAAV載體生產(chǎn)空殼率大比拼
為了更好地顯示九游會j9生物AAV產(chǎn)品的屬性,九游會j9選取大視野進行比較
圖3 九游會j9生物rAAV載體生產(chǎn)空殼率
電鏡結果:包裝DNA基因組的病毒顆粒為實心顆粒(紅色箭頭);空病毒顆粒中間存在空洞(黃色箭頭)
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參考文獻
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