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【九游會j9生物病毒知識分享】用光改變世界,光遺傳學(xué)技術(shù)原理及應(yīng)用

時間:2020-11-27 熱度:

光遺傳學(xué)(optogenetics)是結(jié)合了光學(xué)(optics)及遺傳學(xué)(genetics)的技術(shù),借助其,九游會j9能在活體動物甚至是自由運(yùn)動的動物腦內(nèi)、脊髓、外周神經(jīng)內(nèi),精準(zhǔn)地控制特定種類神經(jīng)元的活動。光遺傳學(xué)在時間上的精確度可達(dá)到毫秒級別,在空間上的精確度則能達(dá)到單個細(xì)胞級別。2010年,光遺傳學(xué)被Nature Methods選為年度方法,同年被Science認(rèn)為是近十年來的突破之一。這項(xiàng)技術(shù)目前在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用非常廣泛,未來可能會應(yīng)用于多種神經(jīng)和精神疾病的治療,如帕金森氏病、阿爾茨海默病、癲癇、脊髓損傷、精神分裂癥等。

光遺傳學(xué)技術(shù)基本原理

簡單地說,光遺傳學(xué)技術(shù)即借助遺傳學(xué)手段,將能夠?qū)馄痦憫?yīng)的通道蛋白表達(dá)在特定細(xì)胞中,實(shí)現(xiàn)通過光來激活或抑制神經(jīng)元活動的目標(biāo)。其中,激活或抑制的原理在于不同通道對陽離子或陰離子的通透:如果轉(zhuǎn)入細(xì)胞的通道是ChR通道,那么在細(xì)胞接受藍(lán)色激光照射時通道開放,陽離子內(nèi)流,會產(chǎn)生去極化電位,誘發(fā)動作電位的發(fā)出,激活細(xì)胞;如果轉(zhuǎn)入細(xì)胞的是HR一類通道的話,細(xì)胞接受黃色激光照射時陰離子內(nèi)流,產(chǎn)生超極化電位,導(dǎo)致動作電位不易發(fā)放,抑制細(xì)胞活動;此外,還有一類光激活或抑制的通道optoXR,給光激活后其改變的是胞內(nèi)激酶系統(tǒng),影響細(xì)胞活動。因此,光遺傳學(xué)技術(shù)的核心技術(shù)差異在于光敏感通道的選擇。

 
光遺傳學(xué)的基本原理(Karl Deisseroth, et al., Annu. Rev. Biomed. Eng., 2014)
 
 
常見的光敏感通道
幾種激活神經(jīng)元的通道蛋白:
  • ChR2(H134R):470nm藍(lán)光激發(fā)。ChR2的突變體,該蛋白質(zhì)可以產(chǎn)生兩倍的光電流,但通道開關(guān)速度也比野生的ChR2慢了一倍。
  • ChETA:470nm左右藍(lán)光激發(fā)。ChR2的突變體,具有更快的動力學(xué)變化,某些神經(jīng)元在激光刺激下可以發(fā)放200Hz的spike。 
  • oChIEF:450nm-470nm藍(lán)光激發(fā)。在某些神經(jīng)元中可以響應(yīng)高頻光(--100Hz)刺激,加速通道關(guān)閉的速度,在持續(xù)光照刺激下減少失活率。
  • ChR2(C128S/D156A):ChR2的突變體,SFO光敏通道,用470nm激活通道,然后用590nm激光關(guān)閉通道,可以打開其離子通道長達(dá)30分鐘。
  • C1V1:540nm-560 nm激發(fā)。紅移視蛋白,該通道蛋白類型更利于雙光子激發(fā)。
  • Chronos:500-530nm激發(fā)。高光敏度及快速開關(guān)動力學(xué)。
  • ChrimsonR:590-600nm激發(fā)。做了K176R的點(diǎn)突變,增加了通道的關(guān)閉速度,適合用于刺激頻率較高的場合。
  • ST-ChroME:530nm左右激發(fā),胞體定位,激活型ChroME通道。
  • ChRger:470nm藍(lán)光激發(fā)。相對無創(chuàng)(光纖放置在顱骨表面)。
  • 幾種抑制神經(jīng)元活動的通道蛋白
  • eNpHR3.0:589nm黃光激發(fā)。第一個有效抑制神經(jīng)元活動的光遺傳學(xué)工具,在黃綠激光照射下會將氯離子打進(jìn)神經(jīng)元內(nèi),而抑制神經(jīng)元活動。當(dāng)把NpHR表達(dá)在哺乳動物腦內(nèi)時,會聚集在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,因此,將內(nèi)質(zhì)網(wǎng)輸出元件、高爾基體輸出元件和來自于鉀離子通道Kir2.1的上膜元件加在NpHR基因序列后面,這樣就能實(shí)現(xiàn)在神經(jīng)元細(xì)胞膜上的高量聚集,修改過的NpHR被稱為eNpHR3.0,因此,eNpHR3.0 對細(xì)胞膜的靶向性較好,電流較為持久,響應(yīng)時間短,反應(yīng)靈敏。
  • Arch:566nm左右激發(fā)。即為archaerhodopsin,是一種黃色激光激活的外向整流質(zhì)子泵,能夠?qū)д姷馁|(zhì)子從神經(jīng)元內(nèi)移動到細(xì)胞外環(huán)境中,使神經(jīng)元處于超極化狀態(tài)。在特定條件下,可用于增加細(xì)胞內(nèi)pH或減少細(xì)胞外基質(zhì)pH。和NpHR相比,當(dāng)激光關(guān)閉的時候,Arch立即從通道打開狀態(tài)恢復(fù)到關(guān)閉狀態(tài)。
  • Mac:540nm激發(fā)。即為 Leptosphaeria maculans fungal opsins,是一種能夠?qū)д姷馁|(zhì)子從神經(jīng)元內(nèi)移動到細(xì)胞外環(huán)境中的質(zhì)子泵,使神經(jīng)元處于超極化狀態(tài)。
  • Jaws:632nm激發(fā),紅移視蛋白,紅光照射下會使氯離子內(nèi)流,從而抑制神經(jīng)元活動。
  • ST-eGtACR1:515nm激發(fā)。GtACR是一個Cl-通道,效率比NpHR、Arch等離子泵高很多,快速抑制。適合照光時間特別短、行為效應(yīng)特別短的情況。ST-eGtACR1為其胞體定位版本。
常見光敏感通道特性(Karl Deisseroth’s, Nat Methods,2012)
 
 
光遺傳學(xué)技術(shù)的應(yīng)用策略
 
借助病毒載體的光遺傳學(xué)技術(shù)應(yīng)用一般包括以下幾個關(guān)鍵步驟:
1、 根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求尋找合適的光敏蛋白;
2、通過病毒載體感染細(xì)胞,將光敏感通道表達(dá)在靶細(xì)胞中;
3、手術(shù)手段向腦中導(dǎo)入光纖,通過控制激光來實(shí)現(xiàn)對神經(jīng)元活動的精準(zhǔn)控制;
4、選擇合適的病毒表達(dá)時間,結(jié)合行為實(shí)驗(yàn)設(shè)置合理的試驗(yàn)方案;
5、行為學(xué)手段或電生理手段驗(yàn)證。
 
光遺傳學(xué)技術(shù)的一般策略(Karl Deisseroth, Scientific American, 2010)
 
光遺傳學(xué)技術(shù)在嚙齒類動物中的應(yīng)用案例
 
Yan-Gang Sun’s lab. Science 2017[1]
 
注射部位:小鼠脊髓
載體:AAV-EF1a-DIO-ChR2(H134R)-mCherry& AAV-hSyn-eNpHR3.0-EYFP
血清型:rAAV2/9
病毒滴度:5.1× 1012 VG/mL&1.7× 1013 VG/mL
注射體積:400-600nl
 
 
Zhong Chen’s lab. Nat Commun, 2020[2]
 
注射部位:PV-Cre小鼠的SNr區(qū)
載體:PV-Cre: AAV-EF1a-DIO-ChR2(H134R)-mCherry & AAV-CAG-FLEX-ArchT-GFP 
病毒滴度:1.7× 1013 VG/mL&1.3× 1012 VG/mL
注射體積:200nl
 
光遺傳學(xué)非人靈長類(NHP)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)資源庫

光遺傳學(xué)技術(shù)的出來可以幫助科研人員更深入的理解大腦與行為之間的神經(jīng)機(jī)制,目前關(guān)于光遺傳學(xué)的應(yīng)用主要集中在嚙齒類小動物模型,為了最大限度的發(fā)揮光遺傳學(xué)的潛力,使其成為研究人類認(rèn)知和行為的重要工具,然而,在這項(xiàng)技術(shù)應(yīng)用于人類之前,謹(jǐn)慎的做法是先在非人類靈長類動物(non-human primates, NHPs)身上證明其安全性和有效性。NHPs的解剖學(xué)、生理學(xué)、遺傳學(xué)和行為學(xué)特征比任何其他動物模型更接近人類。NHP與人類之間的同源性使其成為理解人類大腦功能和障礙的最佳實(shí)驗(yàn)?zāi)P?。利用光遺傳學(xué)從NHPs的細(xì)胞水平、環(huán)路水平及大腦網(wǎng)絡(luò)層面去解析神經(jīng)機(jī)制,有望揭示人類大腦功能和障礙的基本機(jī)制。

然而,在非人靈長類動物上使用光遺傳學(xué)存在不少技術(shù)障礙,比如對于病毒載體、啟動子和視蛋白的選擇,以及注射劑量等等。由于嚙齒動物和NHP之間的解剖學(xué)和遺傳學(xué)差異,意味著那些在嚙齒動物中使用的光遺傳學(xué)策略在NHP中并不總是有效,對于想要開展NHPs光遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)的研究人員來說,實(shí)驗(yàn)的操作指南很少。

 
使用光遺傳學(xué)技術(shù)發(fā)表的文章數(shù)

基于此,2020年10月19日賓夕法尼亞大學(xué)Sébastien Tremblay在《Neuron》在線發(fā)表題為An Open Resource for Non-human Primate Optogenetics的文章[3],綜述了光遺傳在非人靈長類動物模型中的最新進(jìn)展,該文章總結(jié)了世界各地45個實(shí)驗(yàn)室,1000多個注射實(shí)驗(yàn)的方法和結(jié)果(包括未發(fā)表的數(shù)據(jù)),整合成光遺傳學(xué)非人靈長類動物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)資源庫,以幫助擴(kuò)大光遺傳學(xué)在NHPs中的應(yīng)用。

 

該數(shù)據(jù)庫包含6種不同品系的NHP,其中大部分實(shí)驗(yàn)在恒河猴(71%)上進(jìn)行;使用最多的病毒載體為AAV2/5型(36%),其次是AAV2/9型(13%);使用最廣泛的啟動子為CaMKIIa(37%,特異性標(biāo)記投射神經(jīng)元),其次為hSyn(22%,特異性標(biāo)記成熟神經(jīng)元)和CAG(11%,廣譜表達(dá)啟動子)。 此外,在NHP中應(yīng)用最廣泛的報告基因?yàn)镋YFP(45%),其次為GFP(17%)和mCherry(13%)。

同時,該數(shù)據(jù)庫還分析了在NHP中最常用的到光遺傳視蛋白:約39%使用激活型視蛋白--hChR2(H134R)、約25%使用抑制型視蛋白,這其中包括6%的ArchT、6%的Jaws。

隨后,研究人員通過解剖學(xué)、生理學(xué)、行為學(xué)手段來評估光遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)在NHPs中的成功率: 

發(fā)現(xiàn),在食蟹猴(88%)的成功率最高,而AAV2/9和AAV2/8M(Y733F) 的成功率最高,分別為93%和88%,此外,對啟動子分析發(fā)現(xiàn),用CMV和CaMKIIa進(jìn)行NHPs光遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)的成功率最高,分別為85%和84%。

 

在視蛋白方面,eNpHR3.0的成功率最高,為88%;C1V1(T/T),其成功率約為86%,hChR2(H134R),在397次的注射實(shí)驗(yàn)中,產(chǎn)生了85%的成功率。

一般認(rèn)為,較慢的注射速度可以減少對腦組織的創(chuàng)傷,此外,由于NHPs腦相較于嚙齒類動物腦更大更復(fù)雜,病毒載體的注射體積也會影響實(shí)驗(yàn)效果。

從該數(shù)據(jù)庫中分析了注射速率從6 nL/min到5000 nL/min的成功實(shí)驗(yàn),多數(shù)集中在200 nL/min。注射體積多數(shù)為1-3uL。

 
 
光遺傳學(xué)技術(shù)優(yōu)勢
 
1、 時間精確度高:光遺傳技術(shù)可以通過控制激光使時間精準(zhǔn)度到毫秒級別甚至是亞毫秒級;
2、 刺激的強(qiáng)度精確性高:光遺傳技術(shù)通過控制激光,可以精準(zhǔn)地、隨時地調(diào)節(jié)給神經(jīng)元刺激的強(qiáng)度,這對于某些刺激強(qiáng)度依賴的神經(jīng)環(huán)路研究有不可替代的優(yōu)勢;
3、 空間特異性:光遺傳學(xué)技術(shù)可以通過腦定位注射、特異性啟動子、甚至是亞細(xì)胞器定位肽,將光敏感蛋白錨定在靶向細(xì)胞或細(xì)胞器進(jìn)行操作,可達(dá)到單個細(xì)胞的級別,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定位;
4、 作用工具多樣:目前人們已經(jīng)突變了一系列新的光敏感通道,這些通道的時間特性和激發(fā)光要求都不同,可根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行選擇;
5、 作用直接:不像DREADDs技術(shù)依賴于動物代謝水平,光遺傳學(xué)技術(shù)通過激光操控細(xì)胞的激活或抑制,作用直接。
 
參考文獻(xiàn)
[1] Science. 2017 Aug 18;357(6352):695-699. doi: 10.1126/science.aaf4918.
[2] Nat Commun. 2020 Feb 17;11(1):923. doi: 10.1038/s41467-020-14648-8.
[3] Neuron. 2020 Oct 12;S0896-6273(20)30751-0. doi: 10.1016/j.neuron.2020.09.027.


 

九游會j9生物一直致力為神經(jīng)科學(xué)研究提供整體研究方案,從標(biāo)記、示蹤、基因操作、生理操作到觀察,提供病毒包裝、動物模型構(gòu)建、病理研究等一站式服務(wù)。用實(shí)際行動助力中國腦科學(xué)的發(fā)展!

 

 
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