慢病毒系列|讓你“隨心所欲”調(diào)控基因(腫瘤模型篇)
腫瘤模型與腫瘤研究
惡性腫瘤是威脅人類健康及生命的一類常見(jiàn)病、多發(fā)。哂蟹⒉÷矢、治療時(shí)間長(zhǎng)、預(yù)后差等特點(diǎn)。隨著惡性腫瘤威脅人類健康問(wèn)題的加重,無(wú)疑給基礎(chǔ)研究者和臨床醫(yī)護(hù)人員攻克癌癥治療帶來(lái)了巨大的挑戰(zhàn)。為了滿足對(duì)腫瘤發(fā)生發(fā)展機(jī)制以及藥物靶點(diǎn)的研究,一系列的研究方法、技術(shù)手段、疾病模型等應(yīng)運(yùn)而生。
起初,主要是通過(guò)使用在體外長(zhǎng)期培養(yǎng)的細(xì)胞系建立二維培養(yǎng)模型,雖對(duì)體內(nèi)可能發(fā)揮作用的調(diào)控機(jī)制進(jìn)行詳細(xì)的分子分析,但使用長(zhǎng)期建立的細(xì)胞系進(jìn)行藥物反應(yīng)研究的結(jié)果在很大程度上未能轉(zhuǎn)化至臨床。為了解決這一缺點(diǎn),逐漸衍生出不同細(xì)胞系的三維培養(yǎng),一些細(xì)胞系模型也被移植體內(nèi)作為細(xì)胞系衍生的異種移植(CDX)模型。在過(guò)去的幾十年里,皮下或原位開(kāi)發(fā)CDX模型用來(lái)模擬不同的腫瘤患者。然而,CDX模型存在兩個(gè)主要的限制:一是與原發(fā)腫瘤相比,CDX模型不能很好地模擬人體腫瘤的微環(huán)境;二是CDX模型失去了遺傳異質(zhì)性。但因其細(xì)胞系的獲得相對(duì)容易,且細(xì)胞培養(yǎng)、模型構(gòu)建等一系列技術(shù)手段比較成熟,CDX模型也是基礎(chǔ)研究中較為常用的疾病研究模型。
1969年Rygaard和Povlsen將來(lái)自一位71歲的乙狀結(jié)腸癌患者的腫瘤植入裸鼠體內(nèi),并保持了76次傳代,患者來(lái)源的異種移植(PDX)模型便就此問(wèn)世。PDX模型已被證實(shí)早期傳代可維持原發(fā)性腫瘤的遺傳穩(wěn)定性,PDX模型可以保留腫瘤的高分子異質(zhì)性,更好地模擬腫瘤組織,并更準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)抗癌治療的療效。在過(guò)去的幾年里,PDX模型已經(jīng)成為一種很有前途的轉(zhuǎn)化研究工具。它可以在有限條件中保持原始腫瘤的遺傳和組織學(xué)穩(wěn)定性,并為精確的癌癥醫(yī)學(xué)提供線索。
小鼠模型是癌癥臨床前和轉(zhuǎn)化研究的關(guān)鍵工具,包括藥物篩選、療效評(píng)估、生物標(biāo)志物識(shí)別和分子分型等。慢病毒有適用宿主范圍廣、感染效率高、具有生物安全性、整合基因到宿主細(xì)胞實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá)的特點(diǎn)。近年來(lái),也被廣泛用于癌癥的基因機(jī)制與發(fā)生發(fā)展的研究。下面就一起來(lái)了解如何利用慢病毒助力腫瘤的研究。
案例1——慢病毒&CDX模型
PEG10 amplification at 7q21.3 potentiates large-cell transformation in cutaneous T-cell lymphoma
作者單位:北京大學(xué)第一醫(yī)院
IF:25.476
蕈樣真菌病(MF)是皮膚T細(xì)胞淋巴瘤中最常見(jiàn)的類型,晚期可發(fā)生大細(xì)胞轉(zhuǎn)化(LCT),表現(xiàn)為侵襲性行為,對(duì)治療產(chǎn)生耐藥,預(yù)后較差等,但其機(jī)制尚不明確。為了確定LCT分子驅(qū)動(dòng)的因素,研究者收集了133例MF患者的腫瘤樣本,并對(duì)49例晚期MF患者進(jìn)行了全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。在chr7q中,具有LCT的腫瘤顯示出獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄程序和豐富的基因表達(dá)。在LCT來(lái)源的惡性T細(xì)胞中,父系表達(dá)基因10 (PEG10) 由7q21.3擴(kuò)增驅(qū)動(dòng)異位表達(dá)。機(jī)制上,體內(nèi)外研究結(jié)果顯示,PEG10的異常表達(dá)增加細(xì)胞大。俳赴鮒常⑼ü齈EG10/KLF2/NF-κB軸激活治療抵抗。以PEG10為靶點(diǎn)的藥理學(xué)治療逆轉(zhuǎn)了LCT的增殖表型和治療抵抗。本研究揭示了LCT新的分子機(jī)制,并提示抑制PEG10可能作為晚期侵襲性T細(xì)胞淋巴瘤治療的一種有前景的方法。
圖1:PEG10敲低抑制腫瘤的生長(zhǎng)
Fengjie Liu et al, Blood. 2022 Jan 27;139(4):554-571.
★小鼠品系:NOD/scid白介素-2受體γ鏈缺陷小鼠(NSG ,6周齡,雌性)
★基因調(diào)控手段:基因過(guò)表達(dá)(LV-PEG10/KLF2-OE)、基因干擾(LV-shPEG10/KLF2)
九游會(huì)j9生物有幸提供本文所涉及的基因干擾慢病毒包裝服務(wù)
案例2——慢病毒&CDX模型
Identification of RNA?splicing factor Lsm12 as a novel tumor?associated gene and a potent biomarker in Oral Squamous Cell Carcinoma (OSCC)
作者單位:北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院
IF:12.658
口腔鱗狀細(xì)胞癌(Oral squamous cell carcinoma, OSCC)是世界范圍內(nèi)常見(jiàn)的惡性腫瘤之一。由于缺乏特異性生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),導(dǎo)致OSCC患者診斷延遲,從而導(dǎo)致患者預(yù)后不良。因此,尋找OSCC的有效生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)迫在眉睫。研究結(jié)果證明:Lsm12在OSCC動(dòng)物模型中表達(dá)顯著上調(diào),并在OSCC臨床樣本中得到驗(yàn)證。Lsm12的表達(dá)與OSCC細(xì)胞的生長(zhǎng)、克隆形成、遷移和侵襲能力具有相關(guān)性,抑制Lsm12表達(dá)可以明顯抑制體內(nèi)成瘤。Lsm12是一個(gè)新的RNA剪接相關(guān)基因,可調(diào)控USO1第15外顯子的選擇性剪接,與OSCC的發(fā)生密切相關(guān)。因此,Lsm12可能是OSCC有效的生物標(biāo)志物和潛在的治療靶點(diǎn)。
圖2:USO1外顯子15在體內(nèi)成瘤中的作用.
Yan Dong et al. J Exp Clin Cancer Res. 2022 Apr 21;41(1):150.
★小鼠品系:BALB/C裸鼠(4-5周齡)
★基因調(diào)控手段:基因過(guò)表達(dá)(LV-Lsm12/USO1-OE)、基因干擾(LV-shLsm12)
九游會(huì)j9生物有幸提供本文所涉及的基因過(guò)表達(dá)、干擾慢病毒包裝服務(wù)
案例3——慢病毒&PDX+CDX模型
Targeting the splicing factor NONO inhibits GBM progression through GPX1 intron retention
作者單位:山東大學(xué)齊魯醫(yī)院
IF:11.6
剪接因子在新生的pre-mRNA加工過(guò)程中是必不可少的,并且在癌癥進(jìn)展中發(fā)揮了關(guān)鍵的作用,這預(yù)示著具有剪接功能的蛋白質(zhì)是癌癥治療潛在的分子靶點(diǎn)。本研究揭示了剪接因子在多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)進(jìn)展中的作用,以及靶向它們治療GBM的可能性。臨床樣本統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,剪接因子NONO在GBM樣本中表達(dá)較高且與患者的不良生存相關(guān)。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲低NONO抑制了GBM的生長(zhǎng),過(guò)表達(dá)NONO促進(jìn)了GBM的成瘤。機(jī)制研究表明:NONO通過(guò)調(diào)控GPX1的異常剪接從而控制腫瘤生長(zhǎng)、侵襲和氧化還原穩(wěn)態(tài)。NONO的小分子抑制劑Auranofin在小鼠原位異種移植模型中抑制了GBM腫瘤的生長(zhǎng)。本研究證明NONO是GBM中mRNA剪接的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,靶向NONO為GBM的治療提供了一種新的、潛在的治療策略。
圖3:NONO在體內(nèi)對(duì)GBM的增殖和侵襲的影響
Xu Wang et al, Theranostics. 2022; 12(12): 5451-5469.
★小鼠品系:裸鼠(Foxn1nu mut/mut,4周齡,雄性)
★基因調(diào)控手段:基因過(guò)表達(dá)(LV-NONO-OE)、基因干擾(LV-shNONO)
九游會(huì)j9生物有幸提供本文所涉及的基因過(guò)表達(dá)、干擾慢病毒包裝服務(wù)
案例4——慢病毒&CDX模型-皮下瘤內(nèi)注射LV
Risk SNP-induced lncRNA-SLCC1 drives colorectal cancer through activating glycolysis signaling
作者單位:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院
IF:38.104
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)在結(jié)直腸癌(CRC)的發(fā)生發(fā)展中起關(guān)鍵作用。本研究旨在識(shí)別風(fēng)險(xiǎn)SNP誘導(dǎo)的lncRNA并研究它們?cè)贑RC發(fā)展中的作用。首先,研究者確定rs6695584是1q41位點(diǎn)的致病SNP。rs6695584位點(diǎn)A>G的突變產(chǎn)生了BATF蛋白結(jié)合基序,改變了增強(qiáng)子活性,進(jìn)而激活lncSLCC1表達(dá)。lncSLCC1在CRC組織中表達(dá)上調(diào),并且lncSLCC1表達(dá)的增加與CRC患者的不良生存相關(guān)。機(jī)制上,lncRNA-SLCC1與AHR相互作用,并轉(zhuǎn)錄激活糖代謝關(guān)鍵酶HK2的表達(dá),從而驅(qū)動(dòng)糖酵解途徑,加速CRC腫瘤生長(zhǎng)。功能分析顯示lncSLCC1通過(guò)HK2介導(dǎo)誘發(fā)CRC糖酵解激活和腫瘤生長(zhǎng)。此外,HK2在CRC組織中表達(dá)上調(diào),并與lncSLCC1表達(dá)和患者生存呈正相關(guān)。該研究結(jié)果揭示了風(fēng)險(xiǎn)SNP誘導(dǎo)的癌基因lncRNA-SLCC1通過(guò)激活糖酵解途徑促進(jìn)CRC的發(fā)展。
圖4:HK2是lncSLCC1在結(jié)直腸癌中的功能靶基因。
Tingting Yan et al, Signal Transduction and Targeted Therapy. 2021 Feb 19;6(1):70.
★小鼠品系:BALB/C裸鼠(4周齡,雄性)
★基因調(diào)控手段:基因過(guò)表達(dá)(LV-lncSLCC1/HK2-OE)、基因干擾(LV-shlncSLCC1/HK2)
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案例5——慢病毒&CDX模型-原位瘤內(nèi)注射LV
Long-term treatment with valganciclovir improves lentiviral suicide gene therapy of glioblastoma
作者單位:University of Bergen
IF:13.029
**基因治療惡性膠質(zhì)瘤在最新的臨床試驗(yàn)中顯示出良好的效果,但前體藥物的應(yīng)用通常僅限于短期治療(14天)。之前的研究表明,在原位膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)異種移植模型中,有大部分經(jīng)更昔洛韋(GCV)治療的單純皰疹病毒胸苷激酶(HSV-TK)轉(zhuǎn)導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞存活。在研究中,研究者分析了這些TK+腫瘤細(xì)胞是否仍然對(duì)前體藥物治療敏感,以及延長(zhǎng)前體藥物治療是否可以增強(qiáng)治療效果。結(jié)果顯示,與短期(3周)應(yīng)用GCV的患者相比,延長(zhǎng)(3個(gè)月)纈更昔洛韋(valGCV)前體藥物治療產(chǎn)生了顯著的生存優(yōu)勢(shì)。在HSV-TK介導(dǎo)的**基因治療的臨床試驗(yàn)中,應(yīng)考慮用valGCV長(zhǎng)期治療替代GCV短期治療。
圖5:MRI顯示瘤內(nèi)注射編碼TK.007的慢病毒載體。
Jubayer A Hossain et al, Nat Commun. 2019 Jul 11;21(7):890-900.
★小鼠品系:RNU大鼠(健康)
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