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慢病毒系列|讓你“隨心所欲”調(diào)控基因(細胞篇)

時間:2022-09-02 熱度:
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基因調(diào)控與疾病研究

 基因表達調(diào)控是生物體內(nèi)基因表達的調(diào)節(jié)與控制,使細胞中基因表達的過程在時間、空間上處于有序狀態(tài),并對環(huán)境條件的變化作出復(fù)雜反應(yīng)的過程。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究證明,所有的疾。送饃、中毒或營養(yǎng)不良以外,幾乎都跟基因有關(guān)。在疾病研究的領(lǐng)域,基因表達的調(diào)控幾乎是所有生物學(xué)過程的基礎(chǔ)。 某些基因的改變會導(dǎo)致相關(guān)功能的缺失或是激活,與疾病的發(fā)生存在著因果關(guān)系。疾病的驅(qū)動是一個過程,不同基因的改變可能參與疾病形成的不同階段,例如腸癌從癌前病變到腫瘤的過程,早期有APC等基因參與,后期有RAS、PIK3CA等基因參與。當(dāng)科學(xué)家第一次發(fā)現(xiàn)疾病和基因之間關(guān)系的時候,研究者便開始征服疾病之旅——希望找到某種疾病和某一基因之間的關(guān)系。 一把鑰匙開啟一把鎖,某個特定基因的改變導(dǎo)致某種疾病的發(fā)生,人類對疾病認知的更新會帶來治療策略的變革,而新的理論,往往依賴于更便捷、更有效的研究技術(shù)與手段。慢病毒有適用宿主范圍廣、基因容量大、感染效率高、整合基因到宿主細胞實現(xiàn)長期穩(wěn)定表達的特點。近年來,被廣泛用于基因機制與疾病發(fā)生的研究中。下面就一起來了解如何在體外利用慢病毒玩轉(zhuǎn)基因在疾病中的研究。

 


案例1——慢病毒&細胞系

 Identification and Validation of ATF3 Serving as a Potential Biomarker and Correlating With Pharmacotherapy Response and Immune Infiltration Characteristics in Rheumatoid Arthritis
作者單位:中山大學(xué)附屬第八醫(yī)院
IF:6.113

 

雖然抗風(fēng)濕藥物(DMARDs)顯著改善了類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)患者的預(yù)后,但約40%的RA患者治療效果有限。因此,探索新的生物標(biāo)志物以提高RA的治療效果至關(guān)重要。本研究開發(fā)一種新的生物標(biāo)志物,通過體外研究鑒定并驗證了ATF3可以促進RA-FLS和MH7A的增殖、侵襲和遷移,可以在RA治療中作為一種新的生物標(biāo)志物,并且與藥物治療反應(yīng)和免疫細胞浸潤相關(guān)。

 

圖1:ATF3可促進RA-FLS和MH7A細胞的侵襲和遷移
Huan Hu et al, Frontiers in Molecular Biosciences. 2021 Dec 13;8:761841.

★細胞系:RA-FLS(RA成纖維樣滑膜細胞) 、MH7A(人滑膜成纖維細胞系)

★基因調(diào)控手段:基因過表達(LV- ATF3 -OE)、基因干擾(LV- ShATF3)

 

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案例2——慢病毒&原代細胞

 Wnt4 is crucial for cardiac repair by regulating mesenchymal-endothelial transition via the phospho-JNK/JNK
作者單位:廣州醫(yī)科大學(xué)
IF:11.6

 

Wnt4在發(fā)育過程中起著關(guān)鍵作用,并在纖維化損傷過程中再次激活。然而,Wnt4在心臟修復(fù)中的作用尚不清楚。本研究探索Wnt4在急性心肌缺血再灌注損傷中的病理生理作用及機制。通過急性心臟缺血再灌注損傷后Wnt4的時空表達,發(fā)現(xiàn)Wnt4作為一種早期損傷反應(yīng)基因在靠近損傷邊界區(qū)域的心臟成纖維細胞中上調(diào),并與間質(zhì)-內(nèi)皮轉(zhuǎn)化(MEndoT)相關(guān),這是心臟修復(fù)中受損心肌血運重建的有益過程。在心臟成纖維細胞中敲低Wnt4導(dǎo)致MEndoT降低和心功能惡化。研究揭示了Wnt4在心臟修復(fù)中起著關(guān)鍵的作用,參與了磷酸化JNK介導(dǎo)的MEndoT,并且是心臟成纖維細胞靶向治療心臟疾病的關(guān)鍵基因。

 

圖2:Wnt4是MEndoT誘導(dǎo)的關(guān)鍵基因.
Wenyan Dong et al, Theranostics. 2022; 12(9): 4110-4126.

★心肌細胞:來源于成年小鼠心臟

★基因調(diào)控手段:基因干擾(LV-shWnt4/JNK1/JNK2)

 

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案例3——慢病毒&間充質(zhì)干細胞

  ac4C acetylation of RUNX2 catalyzed by NAT10 spurs osteogenesis of BMSCs and prevents ovariectomy-induced bone loss
作者單位:中山大學(xué)附屬第八醫(yī)院
IF:10.183

 

N-乙?;D(zhuǎn)移酶10 (NAT10)是mRNA n4 -乙酰胞苷(ac4C)修飾的關(guān)鍵酶,參與多種細胞過程,與多種疾病相關(guān)。本研究探索了成骨細胞分化與NAT10和ac4C之間的關(guān)系,九游會j9發(fā)現(xiàn)NAT0表達和ac4C的總RNA水平在雙側(cè)卵巢切除(OVX)小鼠和骨質(zhì)疏松患者骨組織中降低。過表達NAT10可逆轉(zhuǎn)骨量丟失,而NAT10抑制劑Remodelin可促進OVX小鼠的骨量丟失。此外,具有低水平ac4C修飾的骨髓間充質(zhì)干細胞(BMSCs)在NAT10沉默的情況下在體外形成較少的鈣結(jié)節(jié),而具有高水平ac4C修飾的BMSCs在NAT10過表達的情況下形成更多的鈣結(jié)節(jié)。NAT10水平異?贍蓯塹賈鹿侵適杷傻幕浦?,NAT10有望成為該疾病潛在的治療靶點。

 

圖3:NAT10在體外正向調(diào)控BMSCs的成骨分化
W. Yang et al, Molecular Therapy: Nucleic Acids. 2021 Jul 2;26:135-147.

★BMSCs:骨髓間充質(zhì)干細胞,通過密度梯度離心法從健康供者骨髓中分離獲得

★基因調(diào)控手段:基因過表達(LV-NAT10-OE)、基因干擾(siNAT10)

 

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案例4——慢病毒&類器官

 Targeting the splicing factor NONO inhibits GBM progression through GPX1 intron retention
作者單位:山東大學(xué)齊魯醫(yī)院
IF:11.6

 

腫瘤已是威脅人類健康的重要因素。治療腫瘤藥物的篩選與腫瘤免疫療法的開發(fā)方興未艾,為腫瘤治療帶來全新的希望。但受到患者作為研究對象的不可操控性,且實驗動物與人差異較大,導(dǎo)致從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化效率極低,腫瘤類器官的興起為轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)提供了全新的技術(shù)平臺。腫瘤類器官研究已經(jīng)成為腫瘤基礎(chǔ)和臨床研究中的重要工具,尤其結(jié)合了基因修飾技術(shù),對揭示腫瘤發(fā)生發(fā)展的機制、快速評估腫瘤藥物與免疫細胞的治療效果意義重大。

 

本文在研究中便利用到類器官模型來探討剪接因子在多形性膠質(zhì)母細胞瘤(GBM)進展中的作用,以及靶向它們來治療GBM的可能性。九游會j9證明了內(nèi)含子保留是發(fā)生在GBM進展中的一個關(guān)鍵的選擇性RNA剪接事件,并且NONO是GBM中mRNA剪接的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。過表達NONO可以促進GBM的成瘤,敲低NONO導(dǎo)致GPX1的異常剪接,抑制腫瘤生長、侵襲等。因此,靶向NONO為GBM的治療提供了一種新的、潛在的治療策略。

 

圖4:體外共培養(yǎng)侵襲試驗
Xu Wang et al, Theranostics. 2022; 12(12): 5451-5469.

★細胞:U251(GBM細胞系)、P3(GBM患者來源的原代細胞)

★基因調(diào)控手段:基因過表達(LV-NONO-OE)、基因干擾(siNONO和sh-NONO)

 

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案例5——慢病毒&分裂篩選標(biāo)記

 Split selectable markers
作者單位:The Jackson Laboratory for Genomic Medicine
IF:17.694

 

篩選標(biāo)記廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因和基因組編輯中,以選擇具有理想基因型的工程細胞。本研究提出了可拆分的篩選標(biāo)記,每一種標(biāo)記都可以在慢病毒的介導(dǎo)下實現(xiàn)多個基因穩(wěn)定共表達。利用慢病毒系統(tǒng),建立并驗證了Hygromycin,Purromycin,Neomycin和Blasticidin resistance抗性基因以及mScarlet熒光蛋白的分裂篩選標(biāo)記體系。分裂篩選標(biāo)記的方法在未來可實現(xiàn)在靶細胞中更多數(shù)量的基因修飾。

 

圖5:三個及以上基因共表達的分裂篩選標(biāo)記體系。
Nathaniel Jillette et al, Nat Commun. 2019 Oct 31;10(1):4968.

★細胞:HEK293T(人胚腎細胞)、U2OS(人骨肉瘤細胞)、HeLa(宮頸癌細胞)

   

九游會j9生物一直致力于病毒載體的研制服務(wù),擁有10萬+的病毒包裝經(jīng)驗/4.6萬+病毒載體庫,包裝GMP級別的病毒質(zhì)粒。九游會j9生物擁有多種慢病毒包裝系統(tǒng):三質(zhì)粒/四質(zhì)粒包裝系統(tǒng)。

 

九游會j9生物可提供過表達/干擾、CRISPR/Cas9、Cumate誘導(dǎo)表達系統(tǒng)、Tet-on/off系統(tǒng)、Cre-loxp系統(tǒng)等專屬您的定制慢病毒,同時也涵蓋CRISPR/Cas9敲除或激活文庫、自噬單標(biāo)或雙標(biāo)、螢光素酶現(xiàn)貨慢病毒產(chǎn)品。

 

結(jié)合九游會j9生物自主研發(fā)獲批專利的Vpack慢病毒包裝系統(tǒng),能夠全面滿足在科學(xué)研究中對基因調(diào)控的需求。值得一提的是,Vpack系統(tǒng)攻克了病毒不出毒和滴度低的問題,能保證lncRNA表達更精確,載體熒光表達更亮,病毒出毒更穩(wěn)定。讓您在對細胞(細胞系、原代細胞、干細胞等)進行基因調(diào)控(過表達、敲低、干擾等)的道路上無后顧之憂。

  

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