文獻(xiàn)速遞 | 轉(zhuǎn)錄組在慢性炎癥研究中的應(yīng)用
轉(zhuǎn)錄調(diào)控是指通過調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄水平來控制基因表達(dá)的過程。它是細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)調(diào)控的重要機(jī)制之一,可以通過激活或抑制轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合來影響基因的轉(zhuǎn)錄過程。慢性炎癥是一種持續(xù)存在的炎癥反應(yīng),與多種疾病的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)。炎癥反應(yīng)的調(diào)控主要涉及到多種信號通路和分子機(jī)制,其中包括轉(zhuǎn)錄調(diào)控。它能通過調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄水平來影響炎癥反應(yīng)的發(fā)生和發(fā)展。進(jìn)一步的研究其在慢性炎癥中的機(jī)制,有助于深入理解炎癥相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制,并為開發(fā)新的治療策略提供理論依據(jù)。
九游會j9生物現(xiàn)推出高通量測序活動(測序平臺為Illumina)
01. 轉(zhuǎn)錄組測序(6G),600元/樣本
02. miRNA測序(10M),1400元/樣本
03. IncRNA測序(12G),1680元/樣本
04. circRNA測序(12G),1680元/樣本
05. 全轉(zhuǎn)錄組測序(15G),2800元/樣本
1 .NRF2活化可重新編程氧化代謝缺陷,以恢復(fù)慢性阻塞性肺疾病的巨噬細(xì)胞功能
文章標(biāo)題:NRF2 Activation Reprograms Defects in Oxidative Metabolism to Restore Macrophage Function in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
發(fā)表期刊:American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine
影響因子:24.7
中科院分區(qū):1區(qū)
發(fā)表時間:2023.4
摘要
慢性阻塞性肺疾病(COPD)是以持續(xù)氣道炎癥和巨噬細(xì)胞功能紊亂為特征的疾病。巨噬細(xì)胞生物能量學(xué)改變導(dǎo)致抗氧化反應(yīng)受損和疾病發(fā)病的程度尚不清楚。本研究對慢性阻塞性肺疾病(COPD)供者和健康供者的AMs和MDMs進(jìn)行了功能、代謝和轉(zhuǎn)錄組分析。研究發(fā)現(xiàn)來自慢性阻塞性肺病供體的AMs和MDMs顯示出糖酵解和線粒體呼吸衍生能量儲備的嚴(yán)重耗竭,由于過度依賴糖酵解導(dǎo)致能量狀態(tài)降低。此外,與NADPH生成酶ME1(蘋果酸酶1)表達(dá)缺陷相關(guān)的氧化還原平衡受損,然而,選擇性激活NRF2可重置COPD轉(zhuǎn)錄組,從而增加TCA循環(huán)中間產(chǎn)物的生成、改善能量狀態(tài)、有利的氧化還原平衡以及巨噬細(xì)胞功能的恢復(fù)。
2 .神經(jīng)元-少突膠質(zhì)細(xì)胞鉀穿梭在Ranvier的節(jié)點(diǎn)處可防止炎癥性脫髓鞘
文章標(biāo)題:Neuron-oligodendrocyte potassium shuttling at nodes of Ranvier protects against inflammatory demyelination
發(fā)表期刊:Journal of Clinical Investigation
影響因子:15.9
中科院分區(qū):1區(qū)
發(fā)表時間:2023.4
摘要
多發(fā)性硬化癥(MS)是一種中樞神經(jīng)系統(tǒng)進(jìn)行性炎癥性脫髓鞘疾病。越來越多的證據(jù)表明,多發(fā)性硬化癥中的脆弱神經(jīng)元隨著時間的推移會表現(xiàn)出致命的代謝衰竭,這種現(xiàn)象被假設(shè)是由慢性過度興奮引起的。軸突Kv7(向外整復(fù))和少突膠質(zhì)細(xì)胞Kir4.1鉀通道在調(diào)節(jié)Ranvier結(jié)及其周圍神經(jīng)元的興奮性方面起著重要作用。本實(shí)驗研究了神經(jīng)元Kv7和少突膠質(zhì)細(xì)胞Kir4.1通道之間的空間和功能關(guān)系,并評估了皮質(zhì)和視網(wǎng)膜投射神經(jīng)元在生理性和炎癥性脫髓鞘條件下的轉(zhuǎn)錄和功能特征。發(fā)現(xiàn)這兩種通道在多發(fā)性硬化癥和實(shí)驗性自身免疫性腦脊髓炎(EAE)中都出現(xiàn)了失調(diào),其中Kir4.1通道長期下調(diào),而Kv7通道亞基在炎癥性脫髓鞘過程中短暫上調(diào)。此外還觀察到,用retigabine開通Kv7通道可降低人和EAE神經(jīng)元的過度興奮性,改善EAE臨床癥狀,并挽救少突膠質(zhì)細(xì)胞-Kir4.1缺陷(OL-Kir4.1缺陷)小鼠的神經(jīng)元病理學(xué)。研究結(jié)果表明,神經(jīng)元-少突膠質(zhì)細(xì)胞的代償相互作用通過Kv7和Kir4.1通道促進(jìn)了恢復(fù)能力,并確定了藥理激活結(jié)節(jié)Kv7通道作為抗炎性脫髓鞘的神經(jīng)保護(hù)策略。
3 .lncRNA LUCAT1在炎癥性疾病中升高,并通過調(diào)節(jié)NR4A2的剪接和穩(wěn)定性來抑制炎癥
文章標(biāo)題:The lncRNA LUCAT1 is elevated in inflammatory disease and restrains inflammation by regulating the splicing and stability of NR4A2
發(fā)表期刊:Proceedings of the national academy of sciences of the united states of America
影響因子:11.1
中科院分區(qū):1區(qū)
發(fā)表時間:2023.1
摘要
核長非編碼RNA LUCAT1是人類髓系細(xì)胞中I型干擾素和炎性細(xì)胞因子表達(dá)的負(fù)反饋調(diào)節(jié)因子。本項研究中,九游會j9明確了LUCAT1抑制炎癥基因表達(dá)的機(jī)理基礎(chǔ)。通過質(zhì)譜法和RNA免疫沉淀法對RNA結(jié)合蛋白進(jìn)行全面鑒定,九游會j9發(fā)現(xiàn)在mRNA的加工和替代剪接中起重要作用的蛋白是LUCAT1結(jié)合蛋白。這些蛋白包括異質(zhì)核糖核蛋白C、M和A2B1。與之相一致的是,缺乏LUCAT1的細(xì)胞改變了特定免疫基因的剪接。特別是,在脂多糖刺激下,核受體4A2(NR4A2)基因的剪接尤其受到影響。因此,在缺乏LUCAT1的細(xì)胞中,NR4A2的表達(dá)減少并延遲。NR4A2缺陷細(xì)胞的免疫基因表達(dá)升高。這些觀察結(jié)果表明,LUCAT1被誘導(dǎo)控制NR4A2的剪接和穩(wěn)定性,而這正是LUCAT1抗炎作用的部分原因。此外,研究還分析了大量的炎癥性腸病患者以及哮喘和慢性阻塞性肺疾病患者。在這些患者中,LUCAT 1水平升高,在這兩種疾病中,與疾病嚴(yán)重程度呈正相關(guān)。這些研究通過mRNAs轉(zhuǎn)錄后調(diào)控確定了LUCAT 1依賴免疫調(diào)節(jié)的關(guān)鍵分子機(jī)制,強(qiáng)調(diào)了其在炎癥性疾病調(diào)控中的作用。
參考文獻(xiàn)
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