靶向代謝組學(xué)相對(duì)于非靶向代謝組學(xué)更有針對(duì)性，將關(guān)注點(diǎn)放在了幾個(gè)或者幾類與生物學(xué)事件相關(guān)的代謝物上，比如膽汁酸、氨基酸、植物激素、能量代謝、神經(jīng)遞質(zhì)、黃酮、類胡蘿卜素、花青素、短鏈脂肪酸等。
使用平臺(tái)主要是三重四級(jí)桿質(zhì)譜儀，通過(guò)多反應(yīng)監(jiān)測(cè)技術(shù)（MRM）進(jìn)行檢測(cè)。代謝物進(jìn)入質(zhì)譜后，只有與給定質(zhì)荷比一致的母離子能通過(guò)第一個(gè)四級(jí)桿并被檢測(cè)，在第二個(gè)四級(jí)桿中目標(biāo)離子發(fā)生碰撞產(chǎn)生子離子碎片，而只有與給定的質(zhì)荷比一致的子離子能通過(guò)第三個(gè)四級(jí)桿并被檢測(cè)到，最后檢測(cè)到的母子離子對(duì)的質(zhì)譜峰與標(biāo)準(zhǔn)曲線比對(duì)得到定量值。
