靶向代謝組學相對于非靶向代謝組學更有針對性，將關(guān)注點放在了幾個或者幾類與生物學事件相關(guān)的代謝物上，比如膽汁酸、氨基酸、植物激素、能量代謝、神經(jīng)遞質(zhì)、黃酮、類胡蘿卜素、花青素、短鏈脂肪酸等。
使用平臺主要是三重四級桿質(zhì)譜儀，通過多反應(yīng)監(jiān)測技術(shù)（MRM）進行檢測。代謝物進入質(zhì)譜后，只有與給定質(zhì)荷比一致的母離子能通過第一個四級桿并被檢測，在第二個四級桿中目標離子發(fā)生碰撞產(chǎn)生子離子碎片，而只有與給定的質(zhì)荷比一致的子離子能通過第三個四級桿并被檢測到，最后檢測到的母子離子對的質(zhì)譜峰與標準曲線比對得到定量值。
