• 摘要

衰老，是許多與衰老相關(guān)的慢性疾病的重要風(fēng)險(xiǎn)因素。然而，不同組織炎癥的機(jī)制和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚未完全闡明。在這里，九游會(huì)j9分析了年輕小鼠和老齡小鼠腎臟和肝臟的轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組，發(fā)現(xiàn)炎癥反應(yīng)的激活是這兩種組織的保守特征。此外，九游會(huì)j9還通過(guò)整合分析揭示了轉(zhuǎn)錄組變化與染色質(zhì)動(dòng)態(tài)之間的聯(lián)系，并發(fā)現(xiàn) AP-1 和 ETS 家族轉(zhuǎn)錄因子 (TF) 是炎癥反應(yīng)的潛在調(diào)控因子。進(jìn)一步的原位驗(yàn)證顯示，c-JUN（AP-1 家族成員之一）主要在老化的腎臟和肝臟細(xì)胞中被激活，而 SPI1（ETS 家族成員之一）的增加則主要是由巨噬細(xì)胞的大量浸潤(rùn)誘導(dǎo)的，這表明這些 TFs 在炎癥中具有不同的機(jī)制。功能數(shù)據(jù)表明，基因敲除 AP-1 家族的主要成員 Fos 能顯著減輕老年腎臟和肝臟的炎癥反應(yīng)。綜上所述，九游會(huì)j9的研究結(jié)果揭示了腎臟和肝臟炎癥反應(yīng)的保守特征和調(diào)控TFs，為開(kāi)發(fā)抗衰老干預(yù)措施提供了新的靶點(diǎn)。

 

2 .識(shí)別銀屑病患者的新型免疫亞型和潛在樞紐基因

 

文章標(biāo)題：Identification of novel immune subtypes and potential hub genes of patients with psoriasis

發(fā)表期刊：Journal of Translational Medicine

影響因子：7.4

中科院分區(qū)：1區(qū)

發(fā)表時(shí)間：2023.3.8
 

• 摘要

牛皮癬是一種常見(jiàn)的慢性復(fù)發(fā)性免疫相關(guān)性炎癥性皮膚病。銀屑病患者復(fù)發(fā)主要是由免疫反應(yīng)障礙引起的。因此，九游會(huì)j9的研究旨在識(shí)別新的免疫亞型，并選擇靶向藥物對(duì)不同亞型的銀屑病進(jìn)行精準(zhǔn)治療。從銀屑病中鑒定出182個(gè)差異表達(dá)的銀屑病基因GSE14905隊(duì)列，其中99個(gè)基因顯著上調(diào)，83個(gè)基因下調(diào)。然后，九游會(huì)j9對(duì)牛皮癬上調(diào)基因進(jìn)行了功能和疾病富集。獲得2個(gè)銀屑病的潛在樞紐基因，包括SOD1、PGD、PPIF、GYS1和AHCY。樞紐基因的高表達(dá)在人銀屑病樣本中得到驗(yàn)證。值得注意的是，牛皮癬的兩種新型免疫亞型被確定并定義為C2和C1。生物信息學(xué)分析表明，C2和C1在免疫細(xì)胞中的富集程度不同。此外，還評(píng)估了適用于不同亞型的候選藥物和作用機(jī)制。


 

3 .轉(zhuǎn)錄組分析治療無(wú)效的兒科潰瘍性結(jié)腸炎患者并探索潛在的疾病發(fā)病機(jī)制

文章標(biāo)題：Transcriptomic analyses of treatment-naïve pediatric ulcerative colitis patients and exploration of underlying disease pathogenesis

發(fā)表期刊：Journal of Translational Medicine

影響因子：7.4

中科院分區(qū)：1區(qū)

發(fā)表時(shí)間：2023.1.16
 

• 摘要

潰瘍性結(jié)腸炎（UC）是一種非特異性慢性炎癥性腸病。本研究采用RNA測(cè)序（RNA-Seq）方法，通過(guò)與健康對(duì)照組兒童進(jìn)行比較，評(píng)估了分層明確、未經(jīng)治療的小兒UC患者的轉(zhuǎn)錄組情況。通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，評(píng)估了UC相關(guān)腸道炎癥和纖維化的驅(qū)動(dòng)機(jī)制。

通過(guò)RNA-Seq分析了五名小兒UC患者和五名健康對(duì)照者的腸粘膜樣本，并通過(guò)qPCR驗(yàn)證了結(jié)果。通過(guò) CRISPR/Cas9 方法敲除了 HLA-DRB5 的表達(dá)，并使用分子生物學(xué)技術(shù)進(jìn)行了其他機(jī)理研究。在這些分析中，發(fā)現(xiàn) 2290 個(gè)基因在 UC 樣本和對(duì)照樣本之間存在差異表達(dá)，其中上調(diào)和下調(diào)的基因分別為 1258 個(gè)和 1032 個(gè)。基因本體分析表明，這些基因富集于細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）相關(guān)過(guò)程，8個(gè)差異表達(dá)的相關(guān)基因中有7個(gè)（PIK3CD、IL1β、IL1α、TIMP1、MMP1、MMP12、COL6A3和HLADRB5）上調(diào)，參與了ECM-受體相互作用和炎癥性腸病相關(guān)途徑。研究發(fā)現(xiàn)，腸道細(xì)菌驅(qū)動(dòng)的 HLA-DRB5 表達(dá)增加會(huì)促進(jìn) IL-1α 的分泌，導(dǎo)致腸道炎癥和纖維化，這可能是治療 UC 的一個(gè)靶點(diǎn)。
 

參考文獻(xiàn)

Li Y, Li L, Tian Y, Luo J, Huang J, Zhang L, Zhang J, Li X, Hu L. Identification of novel immune subtypes and potential hub genes of patients with psoriasis. J Transl Med. 2023 Mar 8;21(1):182. doi: 10.1186/s12967-023-03923-z. PMID: 36890558; PMCID: PMC9993638.

Pang X, Song H, Li X, Xu F, Lei B, Wang F, Xu J, Qi L, Wang L, Tan G. Transcriptomic analyses of treatment-naïve pediatric ulcerative colitis patients and exploration of underlying disease pathogenesis. J Transl Med. 2023 Jan 16;21(1):30. doi: 10.1186/s12967-023-03881-6. PMID: 36647141; PMCID: PMC9843999.
 

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